Farmasötik kimyada ve farmakolojide intervertebral disk dejenerasyonunu önleyebilecek olan ilaçların geliştirilmesi için spesifik moleküllerin hedeflenerek araştırılması önem arz eder. Bir ilacın insan vücudundaki etkisi, ligand (ilaç) ve makromolekül (hedef) arasındaki moleküler etkileşimin bir sonucu olarak meydana gelmektedir. Ligandın etki alanındaki farmakolojik aktivitesi, ligand atomlarının konumuyla ve bu atomlar arasındaki etkileşim şekline bağlıdır. Yapı bazlı ilaç tasarımı, daha etkili ilaçlar tasarlamak için farmakobiyolojik moleküllerin üç boyutlu yapısının kullanılmasını içerir. Bunun önemi, intervertebral disk dejenerasyonunun altında yatan nedenleri ele alacak şekilde uyarlanmış ilaçların geliştirilmesine olanak tanıyan, kesin moleküler hedefleri belirleme potansiyelidir. Bu yaklaşım, ilaç geliştirmenin kesinliğini ve verimliliğini artırarak, daha hedefe yönelik ve etkin tedavilere yol açar ve bu patolojiye sahip bireyler için potansiyel olarak sonuçları iyileştirebilir. Bu derlemede, intervertebral disk dejenerasyonunun giderilebilmesinde biyoinformatik, genomik ve proteomik gibi teknikler kullanarak gerçekleştirilen yapı tabanlı ilaç tasarımında, neden hedef proteini bulmalı ve üç boyutlu yapısını aydınlatmalıyız sorularına yanıt verilebilmesi amaçlandı.